Hola,
desde la misma instalación de win2003 te permite crear, modificar o eliminar particiones.
Buscando en google encontré con éste soft http://www.acronis.com/homecomputing/products/diskdirector/ (http://www.acronis.com/homecomputing/products/diskdirector/)
, espero que te sirva de ayuda si es lo que buscas
,saludos.